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NGS检测的判断检测标准

原创发布者:北检院    发布时间:2025-04-25     点击数:

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NGS检测技术:标准化流程与核心要素解析

新一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)凭借其高通量、高精度的特点,已成为现代医学与生命科学研究的核心工具。为确保检测结果的可靠性与临床适用性,需严格遵循标准化的检测流程。以下从检测样品、项目、方法及仪器等方面,系统阐述NGS检测的关键环节。

一、检测样品类型

NGS检测的适用样本范围广泛,主要包括:

  • 临床样本:血液、组织活检样本(如肿瘤组织)、体液(如胸腹水)以及口腔拭子等。
  • 特殊样本:福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织、游离DNA(cfDNA)及单细胞样本。 所有样本需符合预处理标准,例如血液样本需使用EDTA抗凝管保存,组织样本需在-80℃超低温或特定固定液中储存,运输过程需严格控温以避免核酸降解。

二、检测项目分类

根据应用场景,NGS检测主要覆盖以下领域:

  1. 肿瘤基因检测 涵盖实体瘤和血液肿瘤的驱动基因突变(如EGFR、KRAS)、融合基因(如ALK、ROS1)及微卫星不稳定性(MSI)分析,为靶向治疗和免疫治疗提供依据。
  2. 遗传病筛查 针对单基因遗传病(如地中海贫血、遗传性耳聋)和多基因疾病(如心血管疾病)的致病性变异检测。
  3. 病原微生物检测 通过宏基因组测序(mNGS)快速鉴定细菌、病毒、真菌及寄生虫等病原体,辅助感染性疾病诊断。
  4. 药物基因组学 解析药物代谢相关基因(如CYP2C19、HLA-B*5801)的多态性,指导个体化用药。

三、检测方法标准化流程

NGS检测需通过以下关键步骤完成: 1. 核酸提取与质控 使用磁珠法或离心柱法提取DNA/RNA,并通过分光光度计(如Nanodrop)或荧光定量仪(如Qubit)评估浓度与纯度,确保OD260/280比值介于1.8–2.0。 2. 文库构建 通过片段化、末端修复、接头连接及PCR扩增等步骤制备测序文库,文库质量需经Agilent 2100生物分析仪或qPCR验证。 3. 高通量测序 根据目标区域选择全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)或靶向捕获测序,测序深度需符合临床要求(如肿瘤检测通常需≥500×)。 4. 数据分析与解读 采用生物信息学工具(如BWA、GATK)进行序列比对、变异注释及临床意义分级,最终生成符合指南的检测报告。

四、核心检测仪器

NGS技术依赖高精度设备保障检测效能,常用仪器包括:

  • 测序仪:Illumina NovaSeq 6000、Thermo Fisher Ion GeneStudio S5系列、华大基因MGISEQ-2000。
  • 核酸质控设备:Agilent 2100生物分析仪、Qubit 4.0荧光定量仪。
  • 建库系统:Beckman Coulter Biomek自动化工作站、PCR扩增仪(如ABI Veriti)。
  • 数据分析平台:高性能计算集群(HPCC)及专业分析软件(如CLC Genomics Workbench、Sentieon)。

结语

NGS检测的标准化实施需从样本管理、技术操作到数据解读全程把控。随着技术迭代与行业规范的完善,NGS将进一步推动精准医学的发展,为疾病诊断与治疗提供更高效的解决方案。


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实验仪器

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测试流程

NGS检测的判断检测标准流程

注意事项

1.具体的试验周期以工程师告知的为准。

2.文章中的图片或者标准以及具体的试验方案仅供参考,因为每个样品和项目都有所不同,所以最终以工程师告知的为准。

3.关于(样品量)的需求,最好是先咨询我们的工程师确定,避免不必要的样品损失。

4.加急试验周期一般是五个工作日左右,部分样品有所差异

5.如果对于(NGS检测的判断检测标准)还有什么疑问,可以咨询我们的工程师为您一一解答。

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