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ngs全基因组测序检测

原创发布者:北检院    发布时间:2025-04-09     点击数:

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全基因组测序(WGS)检测技术解析

检测样品

全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)技术适用于多种生物样本类型,包括但不限于:

  • 人类样本:外周血、唾液、组织切片、肿瘤组织、羊水等;
  • 动植物样本:植物叶片、动物毛发、微生物培养物等;
  • 特殊样本:福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织、单细胞悬液等。 样本需满足DNA质量要求(如浓度≥20 ng/μL,纯度OD260/OD280介于1.8–2.0),以确保测序数据的准确性和完整性。

检测项目

全基因组测序的核心检测项目包括:

  1. 基因组变异检测:单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)、拷贝数变异(CNV)、结构变异(SV)等;
  2. 功能注释分析:变异位点与疾病、表型或功能的关联性解析;
  3. 物种鉴定与进化分析:微生物或未知物种的基因组比对及系统发育研究;
  4. 个性化医疗应用:肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)及药物靶点挖掘。

检测方法

全基因组测序的实验流程分为以下关键步骤:

  1. DNA提取与质控:使用磁珠法或酚氯法提取样本DNA,通过琼脂糖凝胶电泳或Qubit定量仪评估质量;
  2. 文库构建:采用片段化(超声或酶切)、末端修复、接头连接及PCR扩增技术制备测序文库;
  3. 高通量测序:基于Illumina NovaSeq 6000或MGI DNBSEQ-T7平台进行双端(PE150)测序,覆盖度≥30×;
  4. 数据分析:通过生物信息学流程(BWA、GATK、ANNOVAR等工具)完成数据比对、变异检测及注释。

检测仪器

全基因组测序的核心仪器与设备包括:

  • 测序仪:Illumina NovaSeq 6000、MGI DNBSEQ-T7、Thermo Fisher Ion GeneStudio S5;
  • 样本制备设备:Beckman Coulter Biomek自动化工作站、Covaris M220超声破碎仪;
  • 质控设备:Agilent 2100生物分析仪、Thermo Fisher Qubit 4.0荧光定量仪;
  • 数据分析平台:Illumina BaseSpace、本地高性能计算集群(HPC)。

全基因组测序技术凭借高分辨率、高灵敏度的特点,已成为精准医学、农业育种及病原体溯源等领域的核心工具。随着测序成本降低与算法优化,其应用范围将进一步扩展,为生命科学研究提供更全面的数据支持。

实验仪器

实验室仪器 实验室仪器 实验室仪器 实验室仪器

测试流程

ngs全基因组测序检测流程

注意事项

1.具体的试验周期以工程师告知的为准。

2.文章中的图片或者标准以及具体的试验方案仅供参考,因为每个样品和项目都有所不同,所以最终以工程师告知的为准。

3.关于(样品量)的需求,最好是先咨询我们的工程师确定,避免不必要的样品损失。

4.加急试验周期一般是五个工作日左右,部分样品有所差异

5.如果对于(ngs全基因组测序检测)还有什么疑问,可以咨询我们的工程师为您一一解答。

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