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全基因组测序检测

原创发布者:北检院    发布时间:2025-04-09     点击数:

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标题:全基因组测序技术解析:从样品到数据的科学探索

导语 全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)作为现代生命科学的核心技术之一,能够全面解析生物体的遗传信息。本文从实际检测流程出发,详细介绍全基因组测序的样品要求、检测项目、方法原理及仪器设备,为科研与临床应用提供参考。

一、检测样品

全基因组测序对样品的质量和纯度要求较高。常规检测样品包括:

  • 人体样本:如外周血(需EDTA抗凝全血)、唾液、组织切片(新鲜或石蜡包埋)等,要求DNA总量≥1 μg,浓度≥20 ng/μL,OD260/280值在1.8~2.0之间。
  • 微生物与动植物样本:需根据物种特性进行细胞裂解和DNA提取,避免多糖、色素等杂质干扰。

二、检测项目

全基因组测序涵盖以下核心分析内容:

  1. 基因组组装与注释:通过比对参考基因组,识别基因结构及功能元件。
  2. 变异检测:包括单核苷酸多态性(SNV)、插入缺失(InDel)、拷贝数变异(CNV)及结构变异(SV)。
  3. 个性化分析:如疾病相关突变筛查、遗传进化分析、药物代谢基因解读等。

三、检测方法

1. 文库构建 采用超声破碎或酶切法将DNA片段化,经末端修复、加接头和PCR扩增,制备适合测序的DNA文库。

2. 测序技术 基于Illumina边合成边测序(Sequencing By Synthesis, SBS)原理,通过荧光信号采集实现高通量并行测序。读长支持PE150(双端150 bp),覆盖度≥30×。

3. 数据分析 原始数据经质控过滤后,通过BWA、GATK等工具进行序列比对和变异识别,结合ANNOVAR、SnpEff等软件完成功能注释。

四、检测仪器

全基因组测序依赖高精度仪器设备,主要包括:

  • 测序仪:Illumina NovaSeq 6000,支持单次运行输出最高6 Tb数据,适用于大规模基因组项目。
  • 辅助设备:Qubit 4.0荧光定量仪(DNA定量)、Agilent 4200 TapeStation(文库质控)、超算集群(数据分析)。

结语

全基因组测序技术正逐步推动精准医学和农业育种等领域的发展。通过标准化样品处理、高效测序平台与智能化分析流程的结合,未来将进一步提升基因组数据的应用价值。

(本文内容基于实验室标准流程撰写,具体检测方案需结合实际需求调整。)

实验仪器

实验室仪器 实验室仪器 实验室仪器 实验室仪器

测试流程

全基因组测序检测流程

注意事项

1.具体的试验周期以工程师告知的为准。

2.文章中的图片或者标准以及具体的试验方案仅供参考,因为每个样品和项目都有所不同,所以最终以工程师告知的为准。

3.关于(样品量)的需求,最好是先咨询我们的工程师确定,避免不必要的样品损失。

4.加急试验周期一般是五个工作日左右,部分样品有所差异

5.如果对于(全基因组测序检测)还有什么疑问,可以咨询我们的工程师为您一一解答。

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