甲基化全基因组测序检测

原创发布者：北检院发布时间：2024-01-19 点击数：

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甲基化全基因组测序检测范围

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甲基化全基因组测序检测项目

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甲基化全基因组测序检测方法

甲基化全基因组测序方法

甲基化全基因组测序是一种用于研究DNA甲基化状态的方法，可对基因组中的甲基化位点进行高通量测序。以下是一些常用的甲基化全基因组测序方法：

1. 甲基化敏感限制性酶测序: 该方法使用甲基化敏感限制酶，如MspI或HpaII，将未甲基化的DNA酶切，然后通过测序技术分析酶切片段的DNA甲基化状态。

2. 甲基化特异性抗体共沉淀测序: 通过使用甲基化特异性抗体，将甲基化的DNA片段与抗体结合，然后通过共沉淀和测序分析甲基化位点。

3. 二亚甲基化测序: 该方法可以检测到DNA甲基化状态的亚甲基化位点。通过使用二亚甲基化特异性抗体将二亚甲基化的DNA片段与抗体结合，然后进行测序和分析。

4. 全基因组甲基化测序: 该方法通过测序技术对全基因组中的甲基化位点进行高通量测定，包括甲基化特异性抗体共沉淀测序、甲基化敏感限制酶测序等。

5. 高分辨率甲基化测序: 使用高通量测序技术对基因组进行深度测序，从而实现高分辨率的甲基化位点检测。

6. 甲基化甲磺酸测序: 通过在DNA甲基化位点上加上亲硫基团，然后使用甲磺酸标记方法进行测序，从而分析甲基化位点。

7. 甲基化特异性PCR: 使用甲基化特异性引物，通过PCR方法扩增甲基化位点的DNA片段，然后通过测序技术分析。

8. 甲基化酶二联测序: 使用两种不同的甲基化酶，在不同的甲基化位点上进行甲基化，并通过测序技术分析两种酶的甲基化效果。

9. 低成本甲基化测序方法: 开发了一些低成本的甲基化测序方法，如Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)、Methylation-sensitive Single-nucleotide Primer Extension Sequencing (MS-SNuPE-Seq)等。

10. 单分子实时测序技术: 使用单分子实时测序技术对基因组中的甲基化位点进行实时监测和测序。