全基因组转录组检测

原创发布者：北检院发布时间：2024-01-19 点击数：

注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。

全基因组转录组检测范围

蛋白质组,表观遗传组,代谢组,细胞组,信号传导组,非编码RNA组,微生物组,遗传组,遗传变异组,多样性组,功能组,结构组,表达组,调控组,介导组,互作组,组装组,修饰组,调控组,分解组

全基因组转录组检测项目

全基因组测序,外显子组测序,基因组重测序,全转录组测序,甲基化测序,SNP检测,插入/缺失突变检测,基因表达差异分析,蛋白质组学分析,微生物组检测,转录因子结合位点分析,剪切变异检测,外源DNA检测,个体疾病相关位点检测,表观遗传分析,疾病相关SNP检测,病毒加载检测,免疫组织化学分析,DNA甲基化分析,组蛋白修饰分析,转录调控网络分析。

全基因组转录组检测方法

全基因组转录组测序方法（RNA-Seq）：

RNA-Seq是一种高通量测序技术，可以用来研究转录组的全面表达情况。该方法基于Illumina或Ion Torrent等平台，通过将RNA提取、转录为cDNA，并进行文库构建和测序，从而获得转录组的信息。

实时定量PCR（qPCR）：

实时定量PCR是一种常用的转录组研究方法，用于定量分析特定基因的转录水平。该方法利用引物和荧光探针与目标基因的转录产物结合，并通过PCR循环的每个阶段监测荧光信号的变化，从而实现对转录水平的定量分析。

原位杂交（ISH）：

原位杂交是一种用来确定特定基因在组织或细胞中表达情况的方法。通过将标记有亲和性探针的核酸与待测样品进行杂交，然后对杂交的探针进行检测，可以确定目标基因的表达位置和强度。

Northern blotting：

Northern blotting是一种传统蛋白质电泳技术，用于检测特定基因的转录水平。该方法利用RNA分子的大小和电荷特性，通过电泳将RNA分离，并使用探针特异性地检测目标基因的转录产物。

核糖核酸电泳（RFLP）：

核糖核酸电泳是一种常用的分析DNA序列差异和基因多态性的方法。该方法通过将DNA进行限制性内切酶切割，然后使用电泳将DNA片段按照大小分离，从而分析DNA序列的差异。

基因芯片技术：

基因芯片技术是一种高通量测序方法，用于同时检测大量基因的转录水平。该方法通过将cDNA文库与固定在芯片上的核酸片段进行杂交，然后使用荧光信号检测技术来确定目标基因的表达水平。

逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）：

逆转录聚合酶链式反应是一种常用的转录组研究方法，用于合成DNA的互补DNA（cDNA）。该方法通过使用逆转录酶将RNA转录为cDNA，然后使用PCR技术扩增目标基因的cDNA片段，并通过凝胶电泳分析进行检测。

转录因子结合位点分析：

转录因子结合位点分析用于研究转录因子与基因的调控关系。该方法通过在基因组中寻找与转录因子结合相关的DNA序列，从而预测转录因子的结合位点，并分析其在转录调控中的功能。

代谢物组学分析：

代谢物组学分析用于研究转录组与代谢物谱之间的关系。该方法通过分析样品中的代谢产物，如代谢物浓度、组成和性质等，来理解转录组在代谢过程中的作用。

差异表达基因分析：

差异表达基因分析用于研究不同条件下转录组的差异表达情况。该方法通过比较不同样品中基因的表达水平，筛选出在不同条件下显著差异表达的基因，并进行功能注释和通路分析。

全基因组转录组检测仪器

PCR cycler, DNA sequencer, microarray scanner, qPCR machine, gel electrophoresis system, high-throughput sequencer, flow cytometer, mass spectrometer, spectrophotometer, microplate reader, capillary electrophoresis system, thermal cycler, fluorescence microscope, cytometer, microarray reader, DNA amplification system, MALDI-TOF mass spectrometer, next-generation sequencer, DNA microarray scanner, digital PCR system